Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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