Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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