Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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