Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IKZF1Q13422 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms