Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
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