Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms