Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD47Q08722 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD47Q08722 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD47Q08722 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CD47Q08722 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD47Q08722 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD47Q08722 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD47Q08722 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD47Q08722 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD47Q08722 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD47Q08722 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD47Q08722 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD47Q08722 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD47Q08722 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD47Q08722 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD47Q08722 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD47Q08722 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CD47Q08722 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD47Q08722 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD47Q08722 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD47Q08722 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD47Q08722 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD47Q08722 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD47Q08722 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD47Q08722 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD47Q08722 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD47Q08722 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD47Q08722 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD47Q08722 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD47Q08722 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD47Q08722 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms