Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms