Protein–RNA interactions for Protein: Q05823

RNASEL, 2-5A-dependent ribonuclease, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASELQ05823 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNASELQ05823 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms