Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms