Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms