Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM193AP78312 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms