Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms