Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBB4BP68371 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms