Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA1P68133 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms