Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKP1P63208 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKP1P63208 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKP1P63208 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKP1P63208 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SKP1P63208 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKP1P63208 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKP1P63208 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKP1P63208 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKP1P63208 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKP1P63208 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKP1P63208 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKP1P63208 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKP1P63208 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKP1P63208 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKP1P63208 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKP1P63208 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKP1P63208 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKP1P63208 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKP1P63208 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKP1P63208 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKP1P63208 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKP1P63208 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKP1P63208 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP1P63208 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP1P63208 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP1P63208 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP1P63208 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP1P63208 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP1P63208 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP1P63208 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP1P63208 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP1P63208 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP1P63208 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP1P63208 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP1P63208 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP1P63208 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP1P63208 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP1P63208 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP1P63208 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP1P63208 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP1P63208 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP1P63208 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP1P63208 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP1P63208 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP1P63208 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP1P63208 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP1P63208 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP1P63208 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP1P63208 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP1P63208 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP1P63208 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP1P63208 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP1P63208 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP1P63208 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP1P63208 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP1P63208 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP1P63208 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms