Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTA2P62736 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms