Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms