Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2FP61218 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms