Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms