Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP1B3P54709 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms