Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms