Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA3P52797 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms