Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSRP3P50461 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms