Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PPARGP37231 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PPARGP37231 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGP37231 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGP37231 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGP37231 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGP37231 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGP37231 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGP37231 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGP37231 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGP37231 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGP37231 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGP37231 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGP37231 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGP37231 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGP37231 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGP37231 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGP37231 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGP37231 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGP37231 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGP37231 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGP37231 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGP37231 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGP37231 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGP37231 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGP37231 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGP37231 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPARGP37231 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGP37231 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGP37231 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGP37231 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGP37231 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGP37231 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGP37231 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGP37231 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGP37231 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGP37231 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGP37231 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGP37231 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGP37231 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGP37231 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGP37231 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGP37231 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGP37231 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGP37231 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGP37231 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGP37231 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGP37231 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGP37231 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPARGP37231 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms