Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms