Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPC1P35052 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPC1P35052 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPC1P35052 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPC1P35052 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPC1P35052 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPC1P35052 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPC1P35052 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPC1P35052 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPC1P35052 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPC1P35052 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPC1P35052 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPC1P35052 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPC1P35052 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPC1P35052 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPC1P35052 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPC1P35052 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPC1P35052 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPC1P35052 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPC1P35052 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPC1P35052 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPC1P35052 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPC1P35052 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPC1P35052 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPC1P35052 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPC1P35052 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPC1P35052 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPC1P35052 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPC1P35052 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPC1P35052 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPC1P35052 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPC1P35052 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPC1P35052 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPC1P35052 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPC1P35052 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPC1P35052 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms