Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms