Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD34P28906 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD34P28906 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms