Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHATP28329 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHATP28329 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHATP28329 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHATP28329 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHATP28329 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHATP28329 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHATP28329 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHATP28329 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHATP28329 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHATP28329 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHATP28329 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHATP28329 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHATP28329 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHATP28329 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHATP28329 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHATP28329 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHATP28329 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHATP28329 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHATP28329 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHATP28329 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHATP28329 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHATP28329 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHATP28329 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHATP28329 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHATP28329 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHATP28329 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHATP28329 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHATP28329 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHATP28329 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHATP28329 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHATP28329 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHATP28329 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHATP28329 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHATP28329 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHATP28329 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHATP28329 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHATP28329 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHATP28329 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHATP28329 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHATP28329 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHATP28329 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHATP28329 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHATP28329 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHATP28329 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHATP28329 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHATP28329 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHATP28329 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHATP28329 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHATP28329 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHATP28329 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHATP28329 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHATP28329 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHATP28329 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHATP28329 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHATP28329 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHATP28329 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHATP28329 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHATP28329 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHATP28329 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHATP28329 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHATP28329 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHATP28329 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHATP28329 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHATP28329 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHATP28329 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHATP28329 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHATP28329 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHATP28329 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHATP28329 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHATP28329 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHATP28329 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms