Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMLP26374 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMLP26374 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMLP26374 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMLP26374 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMLP26374 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMLP26374 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMLP26374 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMLP26374 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMLP26374 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMLP26374 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMLP26374 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMLP26374 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMLP26374 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMLP26374 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMLP26374 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMLP26374 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMLP26374 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMLP26374 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMLP26374 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMLP26374 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMLP26374 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMLP26374 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMLP26374 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMLP26374 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMLP26374 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMLP26374 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMLP26374 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMLP26374 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMLP26374 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMLP26374 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMLP26374 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMLP26374 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMLP26374 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMLP26374 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMLP26374 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMLP26374 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMLP26374 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMLP26374 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMLP26374 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMLP26374 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMLP26374 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMLP26374 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMLP26374 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMLP26374 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMLP26374 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMLP26374 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMLP26374 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMLP26374 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMLP26374 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMLP26374 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMLP26374 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMLP26374 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMLP26374 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMLP26374 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMLP26374 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMLP26374 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMLP26374 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMLP26374 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMLP26374 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMLP26374 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMLP26374 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMLP26374 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMLP26374 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMLP26374 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMLP26374 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMLP26374 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMLP26374 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMLP26374 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMLP26374 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMLP26374 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMLP26374 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMLP26374 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMLP26374 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMLP26374 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMLP26374 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMLP26374 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMLP26374 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMLP26374 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMLP26374 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMLP26374 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMLP26374 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMLP26374 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMLP26374 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMLP26374 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMLP26374 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMLP26374 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMLP26374 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMLP26374 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMLP26374 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMLP26374 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMLP26374 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMLP26374 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMLP26374 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMLP26374 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMLP26374 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMLP26374 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMLP26374 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMLP26374 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMLP26374 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms