Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO1P25800 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO1P25800 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO1P25800 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO1P25800 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO1P25800 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO1P25800 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO1P25800 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO1P25800 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO1P25800 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO1P25800 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO1P25800 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO1P25800 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO1P25800 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO1P25800 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO1P25800 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO1P25800 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO1P25800 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO1P25800 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO1P25800 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO1P25800 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO1P25800 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO1P25800 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO1P25800 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO1P25800 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMO1P25800 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LMO1P25800 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMO1P25800 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMO1P25800 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMO1P25800 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMO1P25800 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO1P25800 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO1P25800 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms