Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSHP23434 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCSHP23434 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
GCSHP23434 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
GCSHP23434 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
GCSHP23434 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
GCSHP23434 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCSHP23434 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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