Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms