Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDSP20132 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDSP20132 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDSP20132 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDSP20132 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDSP20132 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDSP20132 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDSP20132 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDSP20132 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDSP20132 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDSP20132 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDSP20132 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDSP20132 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDSP20132 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDSP20132 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SDSP20132 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDSP20132 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDSP20132 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SDSP20132 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDSP20132 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDSP20132 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDSP20132 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDSP20132 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDSP20132 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SDSP20132 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDSP20132 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDSP20132 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDSP20132 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDSP20132 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDSP20132 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDSP20132 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDSP20132 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDSP20132 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDSP20132 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDSP20132 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDSP20132 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDSP20132 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDSP20132 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDSP20132 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDSP20132 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDSP20132 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDSP20132 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDSP20132 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SDSP20132 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDSP20132 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SDSP20132 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDSP20132 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SDSP20132 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDSP20132 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDSP20132 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDSP20132 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SDSP20132 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDSP20132 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDSP20132 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDSP20132 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDSP20132 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDSP20132 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDSP20132 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDSP20132 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDSP20132 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDSP20132 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDSP20132 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDSP20132 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDSP20132 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDSP20132 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDSP20132 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDSP20132 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDSP20132 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDSP20132 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDSP20132 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDSP20132 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDSP20132 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDSP20132 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDSP20132 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDSP20132 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDSP20132 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDSP20132 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDSP20132 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDSP20132 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDSP20132 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDSP20132 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDSP20132 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDSP20132 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDSP20132 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDSP20132 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDSP20132 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDSP20132 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDSP20132 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDSP20132 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDSP20132 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDSP20132 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDSP20132 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDSP20132 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SDSP20132 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDSP20132 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDSP20132 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDSP20132 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDSP20132 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDSP20132 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDSP20132 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms