Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZKSCAN1P17029 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZKSCAN1P17029 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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