Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms