Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms