Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA4P13612 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms