Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYL1P12980 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYL1P12980 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYL1P12980 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYL1P12980 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYL1P12980 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYL1P12980 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYL1P12980 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYL1P12980 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYL1P12980 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYL1P12980 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYL1P12980 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYL1P12980 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYL1P12980 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYL1P12980 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYL1P12980 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LYL1P12980 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYL1P12980 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYL1P12980 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYL1P12980 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYL1P12980 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYL1P12980 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LYL1P12980 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYL1P12980 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYL1P12980 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LYL1P12980 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LYL1P12980 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYL1P12980 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYL1P12980 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYL1P12980 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYL1P12980 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LYL1P12980 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LYL1P12980 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LYL1P12980 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYL1P12980 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYL1P12980 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LYL1P12980 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYL1P12980 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYL1P12980 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LYL1P12980 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYL1P12980 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LYL1P12980 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYL1P12980 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYL1P12980 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LYL1P12980 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYL1P12980 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LYL1P12980 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LYL1P12980 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYL1P12980 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYL1P12980 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYL1P12980 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LYL1P12980 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYL1P12980 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYL1P12980 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYL1P12980 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LYL1P12980 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYL1P12980 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYL1P12980 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYL1P12980 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms