Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ESRRAP11474 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms