Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HKR1P10072 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HKR1P10072 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms