Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms