Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRPRAP08240 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms