Protein–RNA interactions for Protein: O76071

CIAO1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIAO1O76071 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIAO1O76071 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms