Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms