Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALUO43852 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALUO43852 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALUO43852 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALUO43852 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALUO43852 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALUO43852 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALUO43852 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALUO43852 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALUO43852 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALUO43852 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CALUO43852 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALUO43852 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALUO43852 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CALUO43852 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALUO43852 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALUO43852 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALUO43852 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALUO43852 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALUO43852 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALUO43852 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALUO43852 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALUO43852 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALUO43852 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALUO43852 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALUO43852 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALUO43852 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CALUO43852 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALUO43852 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALUO43852 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALUO43852 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALUO43852 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms