Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APAF1O14727 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APAF1O14727 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APAF1O14727 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APAF1O14727 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APAF1O14727 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APAF1O14727 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APAF1O14727 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
APAF1O14727 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APAF1O14727 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APAF1O14727 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APAF1O14727 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APAF1O14727 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APAF1O14727 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APAF1O14727 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APAF1O14727 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APAF1O14727 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APAF1O14727 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APAF1O14727 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APAF1O14727 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APAF1O14727 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APAF1O14727 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APAF1O14727 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APAF1O14727 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APAF1O14727 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APAF1O14727 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APAF1O14727 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APAF1O14727 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APAF1O14727 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APAF1O14727 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APAF1O14727 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APAF1O14727 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APAF1O14727 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APAF1O14727 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APAF1O14727 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APAF1O14727 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APAF1O14727 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APAF1O14727 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
APAF1O14727 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APAF1O14727 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APAF1O14727 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APAF1O14727 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APAF1O14727 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APAF1O14727 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
APAF1O14727 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
APAF1O14727 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APAF1O14727 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APAF1O14727 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APAF1O14727 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
APAF1O14727 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APAF1O14727 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APAF1O14727 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APAF1O14727 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APAF1O14727 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APAF1O14727 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APAF1O14727 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APAF1O14727 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APAF1O14727 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APAF1O14727 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APAF1O14727 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APAF1O14727 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APAF1O14727 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APAF1O14727 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APAF1O14727 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APAF1O14727 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APAF1O14727 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APAF1O14727 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APAF1O14727 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APAF1O14727 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APAF1O14727 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APAF1O14727 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APAF1O14727 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APAF1O14727 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APAF1O14727 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APAF1O14727 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
APAF1O14727 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
APAF1O14727 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APAF1O14727 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APAF1O14727 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APAF1O14727 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APAF1O14727 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APAF1O14727 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APAF1O14727 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APAF1O14727 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APAF1O14727 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APAF1O14727 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APAF1O14727 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APAF1O14727 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APAF1O14727 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APAF1O14727 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APAF1O14727 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
APAF1O14727 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APAF1O14727 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APAF1O14727 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
APAF1O14727 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
APAF1O14727 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
APAF1O14727 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APAF1O14727 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APAF1O14727 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APAF1O14727 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms