Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QRK9 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QRK9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QRK9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QRK9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QRK9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QRK9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QRK9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QRK9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QRK9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QRK9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QRK9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QRK9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QRK9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QRK9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QRK9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QRK9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QRK9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QRK9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QRK9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
J3QRK9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
J3QRK9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
J3QRK9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
J3QRK9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
J3QRK9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
J3QRK9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
J3QRK9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
J3QRK9 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
J3QRK9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
J3QRK9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
J3QRK9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
J3QRK9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
J3QRK9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
J3QRK9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
J3QRK9 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
J3QRK9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QRK9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QRK9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QRK9 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QRK9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QRK9 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QRK9 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QRK9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QRK9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QRK9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QRK9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QRK9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QRK9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QRK9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms