Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms